Lungsod ang San Manuel de Colohete sa Ondoras. Nahimutang ni sa departamento sa Departamento de Lempira, sa kasadpang bahin sa nasod, 160 km sa kasadpan sa Tegucigalpa ang ulohan sa nasod. 1,677 metros ibabaw sa dagat kahaboga ang nahimutangan sa San Manuel de Colohete, ug adunay 16,000 ka molupyo.